高壓風機一個難點，首先是間隙的調整，也就是兩個葉輪之間及葉輪與機殼和兩端墻板之間所謂的適當間隙，這是風機正常運轉的基礎。如間隙過大，氣體的漏損量大，高壓風機性能下降；反之，如間隙過小，會因機殼與葉輪熱膨脹尺寸不同，在運轉中發生設備事故。一般來說，高壓風機的調整要在專業技術人員指導下進行操作，我們通常建議風機返廠進行維修，我們有專業的技術人員。
其次就是高壓風機噪音的控制，高壓風機在運行時都會產生很大的噪聲，其特點是聲級高、頻帶寬、低頻突出，因此傳播距離遠，危害性也比較大，當然處理的難度也大。另外就是風量的調節，在符合工作要求的前提下節約電能，確實很難做到。
